内容

目次

１章　序　論あるおはなし空間と時間の中の生命セントラル・ドグマとその周辺にあるドグマ観測対象とデータ・アーカイブキュレーション，アノテーション，品質管理ワールド・ワイド・ウェブＵＲＬ　電子出版　コンピュータとコンピュータ科学プログラミング　生物分類法と命名法　配列を利用した系統関係の決定ＳＩＮＥとＬＩＮＥを利用して系統関係を導くデータベース中の類似配列の検索：ＰＳＩ−ＢＬＡＳＴタンパク質の構造についての概説タンパク質の構造様式の階層タンパク質構造の分類タンパク質構造予測とタンパク質工学ＣＡＳＰ　タンパク質工学　医療への応用の展望　将来推奨する読み物　練習，問題，ウェブ問題２章　ゲノムの構成と進化ゲノミクスとプロテオミクス遺伝子タンパク質プロテオーム遺伝情報が伝わっていくしくみを探る地図の間の地図づくり高分解能地図ゲノム中の遺伝子を探し出す原核生物のゲノム大腸菌のゲノム古細菌のゲノムマイコプラズマのゲノム真核生物のゲノム酵母のゲノム線虫のゲノムキイロショウジョウバエのゲノムシロイヌナズナのゲノムヒトのゲノムタンパク質コード遺伝子反復配列ＲＮＡ一塩基多型（ＳＮＰ）人類学における遺伝的多様性遺伝的多様性と個人の同定ウシの家畜化の遺伝的解析ゲノムの進化その遺伝子をちょうだい：遺伝子の水平伝播真核生物の比較ゲノミクス推奨する読み物練習，問題，ウェブ問題３章　アーカイブと情報検索概　説データベースの索引の作成と検索語再検索検索データの解析アーカイブ核酸配列データベースゲノムデータベースタンパク質配列データベース構造データベース“ブティック”データベース発現データベースとプロテオミクスデータベース代謝経路のデータベース文献データベース分子生物学データベースとサーバーの概観アーカイブへの入り口分子生物学データベースへのアクセスＥＮＴＲＥＺＳＲＳＰＩＲＥｘＰＡＳｙＥｎｓｅｍｂｌ我々はどこへ行くのか？推奨する読み物練習，問題，ウェブ問題４章　アラインメントと系統樹配列アラインメント序論ドットプロットドットプロットと配列アラインメント配列の類似度を調べるスコア化の方法２つの配列のアラインメントを計算する変型と一般化データベース検索を高速化するための近似法最適ペアワイズ配列アラインメントのためのダイナミックプログラミングアルゴリズムアラインメトの有意性多重配列アラインメント多重配列アラインメントから構造を推測する多重配列アラインメントをデータベース検索に応用するプロファイルＰＳＩ−ＢＬＡＳＴ隠れマルコフモデル系統学系統樹クラスタリング法分岐論的分類法進化速度のばらつきの問題計算をめぐる考察推奨する読み物練習，問題，ウェブ問題５章　タンパク質の構造と医薬品の発見概　説タンパク質の安定性と折りたたみ主鎖のコンホメーション側　鎖タンパク質の安定性と変性タンパク質の折りたたみ疎水性の応用構造の重ね合わせと構造アラインメントＤＡＬＩタンパク質構造の進化タンパク質構造の分類ＳＣＯＰタンパク質構造の予測とモデリングＣＡＳＰ二次構造予測ホモロジー・モデリングフォールド認識ＣＡＳＰ２０００でのフォールド認識コンホメーション・エネルギーの計算と分子動力学ＲＯＳＥＴＴＡＬＩＮＵＳゲノムにタンパク質構造を割り当てるタンパク質機能の予測機能の分岐：オーソログとパラログ新薬の発見と開発リード化合物コンピュータ支援による薬剤設計推奨する読み物練習，問題，ウェブ問題結び索引