本書では，「生態系管理」，あるいは，「エコシステムマネジメント」と呼ばれる自然環境や資源，生物多様性の管理，復元，そして保全について述べる「生態系管理学」について述べています。生態系の「管理」とは，生態系をトップダウン型に「コントロール」しようとすることではありません。ここでは，人間活動により元の姿（いわゆる自然の姿）とは異なり，何らかの問題（生物多様性や生態系サービスの減少）を抱えてしまった生態系を，より良い状態（生物多様性や生態系サービスが高い状態）へと導くための試行錯誤を指します。本書では，ともすれば曖昧になりがちなエコシステムマネジメントについて，最新の知見を軸に解説します。
　古くは公害問題，1990年代後半からは温暖化にまつわる問題，最近では2010年に愛知県名古屋市で開かれた生物多様性条約第10回締約国会議の際における生物多様性への関心の高まりなど，我が国においても，自然環境の保全に関する関心は高まる一方だといえます。国際連合の枠組みの中でまとめられたミレニアム生態系評価においても，生態系が人間社会に享受する恵み（サービス）の高さが評価されています。自然環境への関心は高まり，生態系や生態系に影響を及ぼす社会に関する知見も蓄積してきています。しかしながら，まだまだ我々は資源を利用しつつ生物多様性をできるだけ保全するためのバランスをうまく見出すことができていません。本書では，このバランスについて考えています。