著者紹介

内容

目次

第1章　生命科学 　1-1　原核細胞と真核細胞 　　細胞の分類とウイルス 　1-2　細胞内小器官 　　細胞内小器官とその役割 　1-3　細胞周期 　　細胞分裂と細胞周期 　1-4　DNA の複製 　　ゲノムDNA の半保存的複製 　1-5　転写 　　ゲノムDNA からのさまざまなRNAの合成 　1-6　翻訳 　　タンパク質の生合成 　1-7　核酸の構造と機能 　　DNAとRNA の構造と機能 　1-8　アミノ酸の構造と性質 　　20種類の生体アミノ酸の構造と性質 　1-9　タンパク質の階層構造 　　タンパク質の役割と一次～四次構造 　1-10　生体膜と膜タンパク質 　　生体膜の構造と膜タンパク質の機能 　1-11　翻訳後修飾 　　タンパク質の翻訳後修飾とその役割 　1-12　免疫と代謝 　　抗体による免疫・生体内物質の代謝パスウェイ 　1-13　シグナル伝達 　　細胞間のシグナル伝達によるコミュニケーション 　1-14　遺伝 　　メンデルの法則による遺伝子の世代間継承 　1-15　ゲノムと生物 　　生物ゲノムのサイズと遺伝子地図 　1-16　ヒトゲノム 　　ヒトゲノムの構造と遺伝的多型 　1-17　遺伝子組換え 　　主要な遺伝子組換え技術 　1-18　ゲノム解析 　　ショットガン法による全ゲノム解読とゲノムワイド解析技術 　1-19　分子生物学実験技術 　　分子生物学分野を飛躍的に発展させた実験技術 　1-20　タンパク質の立体構造決定 　　X線結晶解析法などによるタンパク質の立体構造の解析技術 第2章　計算科学 　2-1　2進数 　　2進数と論理演算 　2-2　論理回路 　　論理回路によるコンピュータ上の論理演算 　2-3　プログラミング言語 　　コンピュータのプログラミング言語と計算の実行 　2-4　マークアップ言語 　　XML などのマークアップ言語によるデータ記述 　2-5　プロトコル 　　ネットワークの通信プロトコルとセキュリティ 　2-6　データ構造 　　プログラム内の代表的なデータ構造 　2-7　二分探索 　　高速にデータを検索する二分探索アルゴリズム 　2-8　ソートアルゴリズム 　　高速にデータを並べ替えるソートアルゴリズム 　2-9　バブルソート 　　基本的なバブルソートのアルゴリズム 　2-10　オートマトン 　　オートマトンによる状態・遷移データの表現 　2-11　リレーショナルデータベース 　　リレーショナルデータベースによるデータの整理 　2-12　SQL 　　SQL によるリレーショナルデータベースの操作 　2-13　正規分布 　　正規分布の性質 　2-14　独立性 　　確率分布と独立性・ベイズ推定 　2-15　統計的検定 　　統計的検定による仮説の検証 　2-16　最尤推定 　　確率分布の最尤法による推定 　2-17　機械学習 　　機械学習とデータマイニング 　2-18　クラスタリング 　　 k平均法によるデータのクラスタリング 　2-19　機械学習の評価 　　感度・特異度による予測法の評価 　2-20　交差検証 　　クロスバリデーション（交差検証）による予測法の評価 第3章　配列解析 　3-1　分子生物学データベース 　　国際的な公共の分子生物学データベース 　3-2　配列アラインメント 　　動的計画法による配列アラインメントの計算 　3-3　スコア行列 　　アミノ酸の類似性スコアとその統計的評価 　3-4　高速な類似配列検索 　　高速に配列を比較するための計算技術 　3-5　ホモロジー検索 　　高速にホモロジー検索するためのプログラム 　3-6　マルチプルアラインメント 　　マルチプルアラインメントによる配列の多重比較 　3-7　モチーフ 　　保存された配列パターン（配列モチーフ）の解析 　3-8　ゲノムプロジェクトと遺伝子予測 　　ゲノム解読と遺伝子予測によるアノテーション 　3-9　タンパク質の機能予測 　　タンパク質の生理学的機能の予測 　3-10　RNA の二次構造予測 　　RNA のもつ二次構造とその予測法 　3-11　ゲノム特徴抽出 　　ゲノム配列の塩基組成などに基づく特徴抽出 　3-12　ゲノム比較 　　ゲノム配列の比較解析とオーソログ解析 第4章　構造解析 　4-1　構造化学 　　ペプチド結合の構造化学 　4-2　タンパク質の立体構造 　　タンパク質立体構造の形成と分子グラフィックス表現 　4-3　構造モチーフ 　　タンパク質立体構造中の超二次構造と構造モチーフ 　4-4　構造分類 　　タンパク質立体構造の分類 　4-5　その他の生体分子の立体構造 　　DNAとRNAの立体構造 　4-6　立体構造データベース 　　立体構造データベースPDBとPDB フォーマット 　4-7　立体構造の比較 　　立体構造を構造重ね合わせにより比較する方法 　4-8　タンパク質立体構造の保存性分析 　　構造重ね合わせによるタンパク質立体構造の保存性分析 　4-9　相互作用分析 　　タンパク質立体構造による相互作用分析 　4-10　マップ分析 　　タンパク質立体構造のマップ分析 　4-11　立体構造予測 　　タンパク質の立体構造を予測する方法 　4-12　分子動力学計算 　　分子動力学計算による分子運動のシミュレーション 第5章　遺伝・進化解析 　5-1　ハーディー・ワインベルク平衡 　　対立遺伝子頻度のハーディー・ワインベルク平衡 　5-2　連鎖解析 　　連鎖解析による遺伝子座の探索 　5-3　遺伝子マーカー 　　遺伝的多型と遺伝子マーカーとしての利用 　5-4　ゲノムワイド関連解析 　　ゲノムワイド関連解析（GWAS）による遺伝子の探索 　5-5　分子進化 　　分子進化の中立説と分子時計 　5-6　進化系統樹 　　進化系統樹の表現方法 　5-7　パラログ・オーソログ 　　進化系統樹によるホモログ・パラログ・オーソログの解析 　5-8　系統推定アルゴリズム 　　系統樹をつくるための系統推定アルゴリズム 第6章　オーミクス解析 　6-1　オーミクス解析の研究手法 　　オーミクス解析に用いる研究手法と実験機器 　6-2　次世代シークエンサ 　　従来型DNA シークエンサと次世代シークエンサ 　6-3　DNA マイクロアレイ 　　DNA マイクロアレイによる遺伝子発現・遺伝的多型などの大量解析 　6-4　タンパク質間相互作用 　　タンパク質間相互作用の大量解析手法 　6-5　遺伝子発現クラスタリング 　　遺伝子発現パターンによるサンプルのクラスタリング 　6-6　微分方程式 　　微分方程式による遺伝子発現量の変動予測 　6-7　システム安定性 　　固有値の分析によるシステムの安定性解析 　6-8　ネットワークの構造と性質 　　ネットワークの構造とダイナミクス 　索引 　練習問題解答一覧 　執筆者一覧