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RNA-Seqデータ解析~WETラボのための超鉄板レシピ~ 改訂版
坊農 秀雅
編
発行年月 |
2023年09月 |
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言語 |
日本語 |
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媒体 |
冊子 |
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ページ数/巻数 |
301p |
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大きさ |
26cm |
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ジャンル |
和書/生命科学、医学、農学/生物学/遺伝学 |
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ISBN |
9784758122672 |
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商品コード |
1036884069 |
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NDC分類 |
467.3 |
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本の性格 |
実務向け |
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新刊案内掲載月 |
2023年11月1週 |
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商品URL
| https://kw.maruzen.co.jp/ims/itemDetail.html?itmCd=1036884069 |
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著者紹介
坊農 秀雅(編者):広島大学 大学院統合生命科学研究科 特任教授
内容
RNA-Seqデータの解析法が"料理レシピのように"step-by-stepでわかる好評書の改訂第2版です.
Apple silicon搭載MacやWindows+Docker環境を前提にしたほか,リファレンスゲノムを用いない解析やメタ解析をさらに充実.
「サンプルXにはどんな種類の細胞が含まれる?」
「サンプルYとサンプルZの違いを規定する遺伝子はなに?」
といった医学・生命科学研究でよく出会うquestionにこれからRNA-Seqでアプローチする方にも,解析法をアップデートしたい方にも,三ツ星おすすめの"超"鉄板レシピが満載です.
著者から更新情報が届く「Annual Updateサービス(※)」も付録しています.
※ 出版1年後を初回として,以降1年ごとに1回,計3回(3年間)の更新を予定
Chapter 1 まずはこれだけ! 解析環境を整える
Chapter 2 データを入手する
Chapter 3 転写産物の発現を定量する
Chapter 4 リファレンスゲノムのない生物でde novo解析を行う
Chapter 5 発現変動遺伝子群を検出する
Chapter 6 サンプル間で発現変動した遺伝子群の機能を推定する
Chapter 7 サンプル間の類似度を比較する
Chapter 8 公共データから興味あるデータを抽出,発現変動遺伝子群を検出する(メタ解析)
Chapter 9 リードカウント以降の統合解析をウェブブラウザで行う
Chapter 10 論文投稿に必須!データを登録・公開する